Dia 1

Dia 2

Terminal Unix

• Arquivos e diretórios: pwd, cd, ls, mkdir, ...
• Histórico e auto-completar
• Pipes e redirecionamento
• Laço em arquivos
• Criando e executando shell scripts
• Encontrando coisas: grep, find, ...
• Referências...

Programando em Python

• Utilizando bibliotecas
• Trabalhando com vetores
• Lendo e visualizando dados
• Criando e utilizando funções
• Laços e condicionais: for, if, else, ...
• Programação defensiva
• Utilizando Python da linha de comando
• Referência...

Controle de Versão com Git

• Criando repositórios
• Salvando mudanças em arquivos: add, commit, ...
• Visualizando alterações: status, diff, ...
• Ignorando arquivos
• Trabalhando com a web: clone, pull, push, ...
• Resolvendo conflitos
• Licenças Abertas
• Onde hospedar seu trabalho e porque
• Referências...

Editor

Quando você está escrevendo um código, é interessante ter um editor de texto otimizado para a escrita de código, com funcionalidades como utilização de cores para palavras chaves. O editor padrão no Mac OS X e Linux é o Vim, que não é famoso por ser intuitivo.

The Bash Shell

Bash é o terminal comumente utilizado. Utilizar um terminal lhe permite fazer tarefas mais complexas de forma mais rápida no seu computador.

Git

Git é o estado da arte dos sistemas de controle de versão. Ele permite você rastrear quem e quando uma uma mudança em dado arquivo ocorreu e oferece a possibilidade de facilmente compartilhar a última versão do seu código em alguns sites como o github.com.

Python

Python tornou-se uma linguagem muito popular para a computação científica e é uma ótima linguagem para ensinar conceitos gerais de programação devido a sua sintaxe de fácil leitura. Nós ensinamos Python 2.7 por ainda ser a versão mais utilizada. Instalar todos os pacotes científicos de Python individualmente pode ser um pouco difícil e por isso recomendamos um instalador que automaticamente instala todos os pacotes.

Python

• Baixe e instale Anaconda CE.
• Utilize todas as opções padrões exceto por selecionar Make Anaconda the default Python.

Git Bash

Baixe e instale Git for Windows. Ele irá disponibilizar Git e Bash no seu computador.

Instalador da Software Carpentry

Esse instalador requer uma conexão de internet.

Depois de instalar Python e Git:

• Baixe esse instalador.
• Se o arquivo abrir diretamente no seu navegador web selecione Arquivo→Salvar Como para baixá-lo no seu computador.
• Click duas vezes no arquivo para executá-lo.

Editor

nano é o editor instalado pelo instalador da Software Carpentry. Ele é um editor básico utilizado nas lições.

Notepad++ é outro popular editor livre para Windows. Depois de instalá-lo você precisa adicionar o diretório onde ele foi instalado no path do seu sistema para que possa invocá-lo pela linha de comando (ou para que outros programas como Git invoque-o por você). Por favor requisite ajuda dos instrutores para fazer isso.

Bash

O terminal padrão em todas as versões do Mac OS X é o bash e portanto você não precisa instalar nada. Você pode acessar o bash pelo Terminal encontrado em /Applications/Utilities. Você provavelmente vai querer manter o Terminal no dock da sua área de trabalho.

Editor

Nos recomendamos Text Wrangler ou Sublime Text. Você também pode utilizar o nano que deveria estar instalado por padrão.

Git

Baixe e instale Git. Para versões antigas do Mac OS X (10.5-10.7) você deve utilizar o instalador mais recente disponível aqui. Utilize o instalador "Leopard" para 10.5 e o instalador "Snow Leopard" para 10.6-10.7.

Python

• Baixe e instale Anaconda CE.
• Utilize todas as opções padrões exceto por selecionar Make Anaconda the default Python.

Bash

O terminal padrão normalmente é bash e você não precisa instalar nada. Se sua máquina estiver configurada de maneira diferente você pode abrir um terminal e digitar bash.

Git

Se Git ainda não encontra-se disponível na sua máquina você pode instalá-lo via o gerenciador de pacotes da sua distribuição (e.g. apt-get ou yum).

Editor

Kate é uma das várias opções para os usuários de Linux. Você também pode utilizar nano que deveria estar pré-instalado.

Python

Recomendamos o all-in-one instalador Anaconda. (A instalação requer que você utilize um terminal e se você não estiver confortável em fazê-lo podemos ajudá-lo durante o workshop.

1. Baixe o instalador correspondente ao seu sistema operacional e salve no diretório do seu usuário.
2. Abra um terminal.
3. Digite

   bash Anaconda-

   e pressione tab. O nome do arquivo que você baixou deve aparecer.
4. Pressione enter. Siga as instruções que aparecerem no terminal. Quando aparecer dois pontos no fim da tela pressione a seta direcional para baixo até obter o fim do texto. Digite yes e pressione enter para aceitar a licença. Pressione enter para aceitar o diretório padrão para a instalação. Digite yes e pressione enter para adicionar Anaconda ao seu PATH (isso irá tornar Anaconda seu interpretador Python padrão).